Velké vojenské střety, které utvářely dějiny galaxií. Od první konfrontace s Ra na Abydosu přes pád System Lordů u Dakary až po osudový útok Lucianské aliance na palubu lodi Destiny. Každá bitva zde znamenala posun v rovnováze sil mezi Tau'ri, Goa'uldy, Wraithy, Ori a dalšími rasami.
Celkem bitev: 81
Daniel a Vala použijí předkovskou základnu v Pegasu k tomu, aby Supergate vrhli do středu černé díry. Loď Ori, která právě procházela, je pohlcena a hrozba invaze Ori do Pegasu je odvrácena.
Tento dvojity plan vyzadoval koordinaci mezi dvema galaxiemi. Daniel Jackson a Vala Mal Doran na Atlantis ziskali pristup ke starobyle Predkovske databazi s informacemi o zpusobu, jak zastavit Supergate. Mezitim McKay a Carterova vymysleli plan: prepojit aktivni Stargate pres cernou diru tak, aby prisel na misteni svet superbrany neprerusitelny proud hmoty. Kdyz se Ori lod pokusila projet Supergate do Mlecne drahy, byla pohlcena gravitacni silou cerne diry. Plan vyzadoval absolutni presnost casovani - McKay musel synchronizovat vstup do cerne diry s okamzikem, kdy Ori lod byla napul v brane. Exploze byla tak silna, ze ozarila celou hvezdnou soustavu.
Travelers - lidsky narod zijici v generacnich lodi - zajali pplk. Shepparda, aby jim pomohl ovladnout opustenou Lantijskou bitvik. Behem priprav je napadla Wraithska hive lod. Spolecne s posadkou Larrinove a McKaye Sheppard pilotoval Lantijskou lod a hive lod znicil pri taktickem manevru s tahanym hyperpohonem.
Niam s frakci hledajici Vzestup byl nucen utect na Atlantis a tam byl deaktivovan. Po jeho navratu se Oberothova frakce militantne ujmula moci a vyhladila zbyvajici reformatory. Cela rasa nasmerovala svoji agresi proti Atlantis a lidskym svetum Pegasu.
Kolja unesl Sheppparda a Wraitha Todda a nutil je hrat hru na zivot a smrt - opakovane Wraith krmil ze Shepparda jako vyhruzku. Sheppard a Todd po nekolikate spojili sily, prerazili strazni a Sheppard zaverecnym vystrelem zabil Kolyu pres rukojmi. Zacatek dlouhodobeho neoficialniho spojenectvi s Toddem.
Po prevyhrani Replikatoru z McKayova nano viru zaivila aliance Tau'ri a Wraithu (vedenych Toddem) udern proti Asuras. Travelers obsadili obeh, hive lode dorazily v hyperprostoru a Atlantis koordinovala palbu. Planeta byla podrobena gravitacnimu kolapsu pomoci satelitu - vznikla cerna dira, ktera Asuras pohltila.
McKay s pomocí Replikátorského kódu spustí kaskádu, která rozloží planetu Asuras na atomy. Sheppard a tým přežívají únikem skokem skrz hyperprostorové okno. Replikátoři Pegasu končí.
Spojenecká flotila se sejde, aby zlikvidovala Supergate Ori. Ori vyšlou čtyři lodě Prima, které během jediné šarvátky zničí téměř všechny lodě aliance. Pouze Odyssey s Atlantis F-302 přežívá – sotva.
Bezprecedentni koalice vsech hlavnich sil galaxie Pegasus se sjednotila proti spolecnemu nepriteli - Asuranskim Replikatorum. Daedalus a Apollo zaujaly pozice na orbite, Cestovatelska flotila pod vedenim Larrin kryly kridla a Wraithove pod vedenim Todda dodali masivni palebnou silu ze svych ulovych lodi. McKay vytvotil upraveny pocitacovy virus, ktery prikazal vsem nanitum na planete shromazdit se do jedineho bodu. Zaroven Carterova a Zelenka naprogramovali gravitacni kolapser - zarizeni, ktere vytvorilo umelou singularitu. Kdyz se nanity shromazdily, Sheppard odpali kollapser a planeta Asuras se zhroutila do cerne diry. Kazdy Asuran v cele galaxii byl vtazen do singularity a zanichen.
Bal'al pomoci casoveho stroje zmenil minulost - zabranil objevu Stargate v Egypte a sam pristal s flotilou na Zemi. Carterova, Jackson a Mitchell uvazli v alternativni linii. Po slozite ceste znovu otevreli antarcticky vyzkum, nasli Achilla a O'Neilla a koordinovali kontraderto. Zaverecna bitva probehla nad Antarktidou - dronove kreslo F-302 odrazilo Bal'ovu flotilu, Mitchell skocil casovou bublinou zpet a opravil casovou cestu.
Po obvineni z porusovani protokolu se Atlantis ocitla pred kvazi-soudem IOA. Cely proces byl ovsem soucasti pokusu odstavit autonomii expedice. McKay a Sheppard nasli skrytou IOA laborator s neautorizovanymi experimenty - vcetne pristroju zachycenych z Wraithskych technologii. Po konfrontaci byla laborator deaktivovana a vlivni clenove IOA zatlaceni do useku.
Wraithove infiltrovali Midway stanici, aby pres ni pronikli na Zemi. Behem boje McKay a Sheppard nahradili spojeni a Carterova z Atlantis nakonec stanici sebedestrukci ukoncila. Vsichni Wraithove byli zniceni, lidske posadce se podarilo evakuovat se zranenymi.